《大明皇帝医案》到底还是失窃了，康熙得知该书是由人市上的苦力拿来换药的，决定一查到底。黑帮头子牟九插柳挡道诈钱，被微服私访的康熙看到了，即令三德子和法印去查牟九的底细和坐车人的身份，原来坐车人是大总管纳岚。牟九到南书屋见纳岚，纳岚要他帮查找医书的下落。牟九在人市找到连锁，诈出了医书的下落，又碰上微服的康熙，牟九见康熙是外地人，欲诈其银两，法印、三德子和他打了起来，兵丁起来赶至，两边的人鸟兽散。康熙三人装作和尚撞开黑窝，却被贼人放恶狗追咬，狼狈不堪。康熙气极，令于世龙带兵捣黑窝。

• 第1集：夜。宫内铁匠房。康熙…
• 第2集：索额图担心享发，着刑…
• 第3集：索额图担心贪污税粮事…
• 第4集：宜妃等担心康熙装扮叫…
• 第5集：五莲县的乡民到青州府…
• 第6集：索安仁狂捕滥抓，企图…
• 第7集：索安仁想用囚车将三德…
• 第8集：宫中小太监偷了一只小…
• 第9集：东北边事不断，康熙派…
• 第10集：《大明皇帝医案》到底…
• 第11集：总管府内，纳岚向小妾…
• 第12集：老太太被强人抢去的房…
• 第13集：康熙为了彻底查清医书…
• 第14集：康熙从连锁嘴里探知找…
• 第15集：南怀仁教康熙学英文C…
• 第16集：康熙决定再次微服私访…
• 第17集：县官宋达安和班得五相…
• 第18集：康熙一脸乌黑架着伤了…
• 第19集：县官宋达安审案自以为…
• 第20集：于世龙给花柳病人治病…
• 第21集：康熙终于查清了班得五…
• 第22集：宫内戏园，康熙及祖母…
• 第23集：苏州府。朱国治贪赃枉…
• 第24集：康熙一行微服来到苏州…
• 第25集：康熙一行在街头，苏州…
• 第26集：专偷官不偷民的飞贼“…
• 第27集：谭一德和朱国治同堂坐…
• 第28集：谭一德在监察府贴出告…
• 第29集：谭一德在于世龙处得不…
• 第30集：接到康熙查办朱国治、… 完